湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物，用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接岩藻糖残基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖结构分析以及寡糖的外切糖苷酶阵列的宝贵工具。1. 高效α-岩藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖；2. 可靠的酶解增加了对外切糖苷酶阵列的信心；3. 可固定在即用型离心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的冻干酶。Genovis的FucosEXO冻干剂以冻干粉的形式提供，装在2000单位的小瓶中，用于2mg糖蛋白的去碳基化。GalNAcEXO 用于有效水解与糖蛋白（Tn 抗原）中的丝氨酸或苏氨酸残基相连的 α-N-乙酰半乳糖胺 （GalNAc）。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

为了证明Genovis的PNGase F冻干和PNGase F固定在各种底物上的去糖基化能力，用PNGase F冻干或PNGase F固定化处理了一系列糖蛋白。使用天然反应条件在一小时内有效去除曲妥珠单抗和依那西普上的所有N-糖，以及西妥昔单抗上的Fc-糖。当加入RapiGest™并在变性条件下进行反应时，西妥昔单抗的所有N-聚糖（包括Fab-聚糖）在PNGase F固定化10分钟内完全去除，PNGase F固定化15分钟内完全去除。在变性反应条件下，PNGase F 在 30 分钟内成功将更复杂的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用变性和还原反应条件，将常用的糖蛋白标准品RNase B在10或15分钟内完全去糖基化，分别使用PNGase F冻干或PNGase F固定化。在天然和变性条件下生成的去糖基化样品与LC-MS分析兼容。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。

Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性，这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解，这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。FucosEXO酶在大肠杆菌中表达，带有His标签，分子量为87 kDa和64 kDa，在6至8的pH值范围内显示出高活性。

用于水解β1-3,4-连接半乳糖的固定化酶在离心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalactEXO酶，用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解，而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱；2. 提高酶与底物的比例，提高消化效率；3. z终样品中不含酶。GalactEXO 酶来源于 Akkermansia muciniphila 并重组表达，可有效水解 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖。GalactEXO微离心柱经过格式化，可在30-60分钟内水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性，现有的O-糖释放化学方法不太适合下游分析。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

α连接的Genovis的GalNAcs的水解：GalNAcEXO 是一种 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶，可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 残基。与丝氨酸或苏氨酸连接的 GalNAc（称为 Tn 抗原）被 GalNAcEXO 快速有效地水解，并且该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAcs 上显示出活性。Genovis的GalNAcEXO 是一种外α-N-乙酰半乳糖胺酶，用于有效水解与糖蛋白（Tn 抗原）中的丝氨酸或苏氨酸残基相连的 α-N-乙酰半乳糖胺 （GalNAc）。该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAc 上显示活性。GalNAcEXO 在天然条件下水解糖蛋白上的 GalNAc，在 pH 值 6.0 至 7.6 范围内具有高度活性。湖南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究