由于蛋白质的O-糖模式的异质性和O-糖结构的OpeRATOR特异性,形成了重叠的肽,从而可以获得O-糖位点的完整图谱为了进行比较,相同材料的标准胰蛋白酶消化物, 显示难以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR进行O-糖位点定位:OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶,可消化丝氨酸和苏氨酸糖基化位点的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。这会产生携带O-糖的糖肽,并能够使用质谱法进行O-糖分析、O-糖肽图谱以及中级分析。下面是OpeRATOR消解位点的示意图。亲和纯化微离心柱,SialEXO 冻干 200 单位,OpeRATOR 冻干 200 单位。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
C1抑制剂的去糖基化:在O-糖基化生物制药的生产过程中,由于he心GalNAc残基的加工不完全,可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在,可以应用以下工作流程,此处在重度(26 个位点)O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先,使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖,使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试 :依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子,携带 13 个 O-聚糖位点,其中平均 9 至 10 个位点被占用。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究使用OpeRATOR进行O-糖位点定位:OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶。
GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。
Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖:依那西普是一种融合蛋白,由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇,使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性,制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品:(i)携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白,(ii)用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基, 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品(图1)。作为比较,SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中,以将Fc区与大多数C端糖肽分离,以促进其表征。在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。
genovis分析依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖:为了确认依那西普和曲妥珠单抗中半乳糖损失的LC-MS数据,进行了释放的N-聚糖分析。标记的N-聚糖的分离清楚地表明了依那西普和曲妥珠单抗上半乳糖的丢失,如半乳糖基化聚糖物种的信号丢失所示。该酶是一种有价值的工具,可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。1. 高效 α-N-乙酰半乳糖胺酶 – 快速、完全去除 Tn-抗原和 α1-3-连接的 GalNAc;2. 实现完全糖基去除,以改善蛋白质表征;3. 可固定在即用型离心柱中。用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。包括2000个单位SialEXO冻干酶。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
用SialEXO处理血清,上样于GlycOCATCH,洗涤,洗脱O-糖基化蛋白。Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
蛋白质的N-糖基化特征是一个关键的质量属性。它会影响生物制药的安全性和有效性,因此需要在开发和生产过程中进行表征和监测。常见的聚糖分析工作流程是用PNGase F释放N-聚糖,然后用荧光标记物(如2-AB、2-AA、普鲁卡因胺或RapiFluor-MS™(沃特世公司))标记生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛细管电泳分离标记的聚糖,以表征和定量不同的聚糖结构。 在这里,使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠单抗和依那西普在天然条件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小时,而RNase B需要变性和还原才能完全去糖基化。因此,在50°C下用PNGase F去糖基化10分钟之前,用RapiGest™ SF表面活性剂(沃特世公司)和TCEP处理RNase B。 用RapiFluor-MS标记所得游离的聚糖,并通过HILIC UPLC-FLD-MS进行分析。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究