Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖:依那西普是一种融合蛋白,由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇,使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性,制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品:(i)携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白,(ii)用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基, 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品(图1)。作为比较,SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中,以将Fc区与大多数C端糖肽分离,以促进其表征。用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。包括2000个单位SialEXO冻干酶。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶瑞典GenovisImpaRATOR酶产生携带 O-糖的糖肽。
使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析:依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 (EPO) 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能,需要去除唾液酸助剂,因此购买中包括2000个单位(如果SialEXO冻干)。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后,O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。
经过多年的经验积累及市场积淀,倍笃生物已组合多条不同产品线,分别满足体外诊断、organoid及干细胞、细胞基因药物等领域的需求。其中,细胞基因药物领域产品线包含SAN HQ高盐核酸酶及M-SAN HQ中盐核酸酶、泊洛沙姆P 188 Bio、GMP级MSC/PSC培养基、GMP级胶原酶、AAV滴度检测产品、工艺杂质及外源污染物残留检测产品、聚糖分析用酶、ADC偶联技术、QED抗体对、AAV中和抗体、蛋白酶等;相关品牌有挪威ArcticZymes Technologies、德国BASF、德国Sartorius、德国Nordmark、瑞典Genovis、美国QED、中国君研生物等。FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶;
使用Genovis的GalNAcEXO 对 O-糖基化生物制药进行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖导致了复杂生物制药的异质性,使其分析更具挑战性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc残基组成,通过糖苷键与丝氨酸或苏氨酸连接,称为Tn抗原。 现在,使用GalNAcEXO可以采用合适的酶策略来去除这些GalNAc并简化生物制药的表征。在质谱图中可以观察到重复峰的模式。其次,在与GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc残基被完全去除,留下一个峰。因此,该工作流程确认了 O-糖基化生物制药上存在 Tn 抗原,并允许定量he心 GalNAc 水平。这种工作流程的另一个好处是减少了剩余的异质性,这有助于确认蛋白质的完整质量,并揭示截短的片段。SialEXO、FabRICATOR消化去糖基化蛋白,通过中级质谱测定完整质量数。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,应用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc残基。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
genovis分析依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖:为了确认依那西普和曲妥珠单抗中半乳糖损失的LC-MS数据,进行了释放的N-聚糖分析。标记的N-聚糖的分离清楚地表明了依那西普和曲妥珠单抗上半乳糖的丢失,如半乳糖基化聚糖物种的信号丢失所示。该酶是一种有价值的工具,可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。1. 高效 α-N-乙酰半乳糖胺酶 – 快速、完全去除 Tn-抗原和 α1-3-连接的 GalNAc;2. 实现完全糖基去除,以改善蛋白质表征;3. 可固定在即用型离心柱中。北京N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis