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江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

来源: 发布时间:2024年07月16日

为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性,将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时,OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化:O-糖基化生物制药(如依那西普)很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数,我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。而用其他岩藻糖酶处理部分去除岩藻糖或根本没有去除。江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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Genovis的SialEXO产品是用于去除和分析唾液酸的唾液酸酶。这些酶对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。SialEXO用于在用OpeRATOR或OglyZOR消化之前预处理O-糖基化蛋白。其他应用包括降低样品复杂性、电荷异构体分析和外切糖苷酶阵列。N-连接、O-连接和游离聚糖的高效去唾液酸化快速去除唾液酸,增强对蛋白质电荷变体的分析可固定在即用型离心柱中。然后可以用FabRICATOR消化所得的去糖基化蛋白,并通过中级质谱分析。我们将该工作流程应用于依那西普的分析,虽然未经处理的TNFR结构域过于复杂而无法分析,但O-聚糖组成可以在用PNGase F处理后进行分离和比较。江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究而不会用酶污染z终制剂,可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。

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Genovis的PNGase F Automation 含有以自动化友好的 96 孔板形式冻干的 PNGase F 酶。它能够实现高通量 N-糖去除,从而简化一系列糖蛋白底物的下游分析。根据您的工作流程要求和样品可用性。PNGase F Automation 可在 96 孔板中冻干,用于 96 x 5 μg 或 96 x 50 μg 糖蛋白上的 N-糖自动水解。1. 实现自动化高通量样品处理;2. 可同时消解多达 96 个样品;3. 两种选择可用于不同样品量的消解;4. 即用型 - 只需添加您的样品即可。用于消化粘蛋白型O-糖蛋白和肽(包括唾液酸化O-聚糖)的冻干酶。Genovis的ImpaRATOR 冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在 2000 单位小瓶中,用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2.以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可!

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。SialEXO冻干由两种唾液酸酶组成,每种唾液酸酶都具有独特的活性,并且它们同时起作用。

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用于离心柱中糖蛋白去胶基化的固定化酶。Genovis的FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶,用于糖蛋白的去氟糖基化,而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去胶基化。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. z终样品中不含酶。有效去除α1-2,3,4连接岩藻糖:分析用复杂聚糖结构修饰的糖蛋白可能具有挑战性,需要高效和特异性的酶学工具。Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于有效水解 N-和 O-糖蛋白或寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖残基,无需辅助因子或添加FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO对α1-6连接的岩藻糖残基没有活性。江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

由于GlycOCATCH树脂和O-糖蛋白/肽之间的强相互作用。江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

为了证明Genovis的PNGase F冻干和PNGase F固定在各种底物上的去糖基化能力,用PNGase F冻干或PNGase F固定化处理了一系列糖蛋白。使用天然反应条件在一小时内有效去除曲妥珠单抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔单抗上的Fc-糖。当加入RapiGest™并在变性条件下进行反应时,西妥昔单抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分钟内完全去除,PNGase F固定化15分钟内完全去除。在变性反应条件下,PNGase F 在 30 分钟内成功将更复杂的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用变性和还原反应条件,将常用的糖蛋白标准品RNase B在10或15分钟内完全去糖基化,分别使用PNGase F冻干或PNGase F固定化。在天然和变性条件下生成的去糖基化样品与LC-MS分析兼容。江苏瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究