Real-time PCR原理:所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。DNA结合染料法,应用一种带有荧光的、非特异的DNA结合染料检测PCR过程中积累的扩增产物。检测所有双链DNA扩增产物,包括非特异反应产物,如引物二聚体。可对任何双链DNA进行定量;不需要探针,因此减少了实验设计及运转成本;适合于大量基因的分析;简单易用。实时荧光定量PCR:实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。实时荧光定量PCR以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。连云港组织数字PCR原理及步骤
引物的设计对于这个实验至关重要,因为Real-time PCR的检测灵敏度比较高,所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道,还有几点必须注意:1,引物的错配率(引物错配形成引物二聚体,但是SYBR照样能嵌入进去,结果导致实验结果的误差很大,重复性也不好)。2,引物的特异性一定要高(不像常规PCR,引物同源性不高,只要两条产物的片段长度相差足够大,在电泳的时候能够区分开就可以。Real-time PCR只有在熔解曲线的时候能分开,所以这就造成整个实验结果误差很大,不可信)。连云港组织数字PCR原理及步骤由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。
Real-timePCR技术服务聚合酶链式反应的试验污染:实验室中克隆质粒的污染:在分子生物学实验室及某些用克隆质粒做阳性对照的检验室,这个问题也比较常见。因为克隆质粒在单位容积内含量相当高,另外在纯化过程中需用较多的用具及试剂,而且在活细胞内的质粒,由于活细胞的生长繁殖的简便性及具有很强的生命力。其污染可能性也很大。污染的监测:一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重复性试验。选择不同区域的引物进行PCR扩增。
Real-time PCR-传统定量PCR:扩增后用内切酶消化PCR产物,竞争性模板的产物被酶解为两个片段,而待测模板不被酶切,可通过电泳或高效液相将两种产物分开,分别测定荧光强度,根据已知模板推测未知模板的起始拷贝数。PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等标记引物,扩增产物被固相板上特异的探针所结合,再加入抗地高辛或生物素酶标抗体-辣根过氧化物酶结合物,之后酶使底物显色。常规的PCR-ELISA法只是定性实验,若加入内标,作出标准曲线,也可实现定量检测目的。Real-time PCR在实验过程中为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。
Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反应体系中加入荧光物质,然后通过荧光化学物质监测每次PCR反应循环后产物总量的方法,之后通过内参法或外参法对待测样品中的特定DNA序列(目的基因)进行定量分析的方法。实验过程中,这些荧光物质可以在激发光的作用下释放出一定波长的发射光,定量用PCR仪通过对这些发射光进行实时监测,较终可以描绘出整个PCR的反应过程,这就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR链式反应:DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。但是,DNA聚合酶在高温时会失活。在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同。连云港组织数字PCR原理及步骤
Real-time PCR利用萤光信号累积实时监测整个PCR进程。连云港组织数字PCR原理及步骤
聚合酶链反应注意事项:在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照;内参的设定主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差;PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定;防止DNA的污染:采用DNA酶处理RNA;在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。聚合酶链反应可以选择这些突变来理解蛋白质是如何完成其功能的,并改变或改善蛋白质功能。连云港组织数字PCR原理及步骤
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