定量PCR和数字PCR的特点:1.在20多年的使用和发展中,定量PCR作为一种技术平台,已经产出海量的数据,在工业界和分子检测的某些应用上,定量PCR已经成为“金标准”。基础研究方面,则形成了被称为MIQE的“定量PCR标准实验指南”。2.在定量PCR的各种应用中,基因表达分析(geneexpressionanalysis)的应用比重约占七成,综合各种因素来看,眼下定量PCR还是进行基因表达研究的理想手段。3.上述的“各种因素”具体展开,主要包括:通量、自动化程度、各种检测探针与染料、检测通道、成本和可参考文献与protocol的数目等等。4.就目前市场上已有的数字PCR设备来看,定量PCR在检测的线性范围上具有优势,意味着同一个run内可对各种表达丰度的样品进行分析。具备一键式自动化操作。南通国产数字PCR品牌
研究方向
甲基化含量鉴定
作为表观遗传学研究中重要的一个研究方向——甲基化程度分析,现阶段有不同的方法或技术来进行研究:如传统的亚硫酸氢盐处理后的克隆测序统计法、抗体检测法、定量PCR检测法等。这些方法皆因方法学的问题而不能获得精确的定量,而微滴式数字PCR系统通过对样品的微滴化处理及目标因子的***拷贝数定量,为甲基化程度的精确定量检测提供了一种全新的技术。
*****的伴随诊断
常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现**标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺*/胃*的HER2基因扩增检测等,应用于**精细医学的伴随诊断。 南通国产数字PCR品牌基因表达差异的监测。
同时,从公式也可以看出,随着反应阳性体系数(X)的增加,体系中目标分子的拷贝数相对于X会有较大的差距,随着X的持续增加,数字PCR结果的不确定度也随着提高,总体来说,数字PCR阳性体系的数量不得超过总体系数量的80%。另一个方面,N的增加会使整个数字PCR体系具有较大的线性范围,并可以提高反应的灵敏度、稳定性以及可重复性。因此,目前dPCR都需要在成本可控的情况下,增加分配的腔室数和液滴数。商业化dPCR平台及其特点发展到现在,市面上常见的dPCR主要有两种:微滴式dPCR(dropletdPCR,ddPCR)和芯片式dPCR(chipdPCR,cdPCR)技术。由于芯片式dPCR制造芯片的成本较高,目前微滴式dPCR正越来越受到企业的认可。
研究方向病原微生物的检测(***、细菌等)疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室目前主要采用基于TaqMan探针法的定量PCR体系对病原微生物进行核酸水平的检测,而这些目前正在使用着的检测体系可以无缝地转移到QX200上,从而满足该类实验室对于检测结果的要求:灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的***定量结果,同时操作简便。对于其他类型的研究实验室,也可以利用ddPCR灵敏度高的特点,对各种样品中的病原微生物展开***的研究。如HIV抗逆转录***治疗过程中***残留量的监控;HBV耐药突变的检测;HCV的分子分型;抗甲氧西林金黄色葡萄球菌的院内***监控;环境微生物不同功能基因之间的连锁分析等等。超高灵敏度,适用于稀有序列及稀有突变的检测。
微滴式数字PCR系统在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。与传统PCR相比所具有的优势不依赖Ct值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的***数目。微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用。单细胞研究:测序、PCR。南通国产数字PCR品牌
MicroDrop™数字PCR平台是由永诺生物自主研发并已投入生产的微滴式数字PCR检测系统。南通国产数字PCR品牌
相对于二代测序、基因芯片和定量PCR而言,数字PCR具备以下优势:·能够有效区分浓度差异微小的样品:更好的准确度、精密度和重复性,可以用于精确测定靶基因的相对表达,基因拷贝数变异分析等。·数字PCR可开发针对不同**、不同样本以及不同的样本环境提供检测解决方案,该技术的应用范围广,尤其在液体活检领域,已开发针对肺*、乳腺*、肠*、胃*等上百个位点检测试剂盒,可精细指导临床***的诊断,以便患者在后续得到更及时并且适当的***方案提供。南通国产数字PCR品牌
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