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河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

来源: 发布时间:2024年11月18日

样品制备的条件可能会在样品中诱发伪影,因此需要避免高温和碱性pH值进行质谱分析。如果可能的话,避免多个步骤并在一锅反应中进行消化和还原也可能是有益的。与IdeS不同,为了探索Genovis的GingisREX对离液剂和去液剂的稳定性和耐受性,在一系列试剂中测试了酶活性,并使用底物测定进行了评估。数据显示,GingisREX在6M时耐受尿素,吐温高达1%,但活性在0.1%时受到SDC的负面影响。该酶在 pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性,在 pH 值为 6.5-8.0 之间。综上所述,GingisREX可用于一锅反应,以同时消化和变性6M尿素。与Genovis的IdeS不同,双特异性 T 细胞接合器 (BiTE) 分子是一种融合蛋白疗法,其中两个 scFv 融合,形成一个双特异性分子,其中一个 scFv 靶向细胞毒性 T 细胞,另一个靶向Ai症抗原。该蛋白质由四个蛋白质结构域组成,两个 scFv 均由 VL 和 VH 区域组成,总共由三个柔性 GS 连接子连接。这种蛋白质的大尺寸(54 kDa)可能对通过完整质谱法进行产品质量监测构成挑战,因为标准MS仪器可能无法提供蛋白质的单同位素分辨率。孵育时间为过夜(16-18小时),并且由于酶的特异性,没有过度消化的风险。河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

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抗体的氧化是可能影响抗体功能的关键质量属性,需要密切定量和表征。它可能导致mAb的体内半衰期、功效和稳定性降低。Genovis的FabRICATOR(IdeS)消化产生的抗体亚基是研究抗体氧化的理想选择。酶解的稳健性允许在受监管的环境中监测抗体亚基氧化。Genovis的FabRICATOR(IdeS)是一种IgG特异性半胱氨酸蛋白酶,可消化铰链下方单个氨基酸位点的抗体,产生均质的F(ab')2和Fc片段。该酶用于基于抗体的疗法(如mAb、ADC、生物类似药和Fc融合蛋白)的表征、质量控制、稳定性测试、生产监测和克隆选择。高度特异性-铰链下方的一个消化位点快速–在30分钟内生成均匀的片段池实现基于抗体的生物zhiliao药物的表征和质量控制可固定在即用型离心柱中河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 18 kDa。

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抗体由于其大小和复杂性,是一种难以表征的分子。偶联药物有效载荷是对抗Ai症等疾病的一种有吸引力的方法,但进一步增加了异质性的复杂性和风险。抗体药物偶联物 (ADC) 需要像任何其他基于 IgG 的生物制药一样进行仔细和详细的表征,并且需要适当的分析工作流程。Genovis的FabRICATOR(IdeS)酶将ADC消化成其亚基,可以详细表征这类复杂的药物。Genovis的内切糖苷酶 IgGZERO和 GlycINATOR 还可以研究完整的 ADC,但降低复杂性并提高分辨率。

一些应用(如结合研究)具有高度灵敏度,因此在制备中需要不含残留酶的纯抗体片段。因此,Genovis的 IgG 特异性蛋白酶也以固定化酶提供,可快速轻松地生成均质 F(ab')2 和 Fc/2 片段。FabRICATOR Immobilized 含有固定化的 FabRICATOR (IdeS),用于制备来自多种 IgG 的 F(ab')2 和 Fc 片段(对于兔 IgG,请咨询),而小鼠 IgG2a 和 IgG3 可以使用含有 FabRICATOR Z Immobilized 的 FabRICATOR Z Fab2 试剂盒进行处理 。 为了生成和纯化完整的 F(ab')2 和 Fc/2 片段,使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒处理曲妥珠单抗,并通过 SDS-page 进行分析。首先,在室温下在FabRICATOR固定化离心柱上消化抗体15分钟,然后进行短离心步骤。在 CaptureSelect ™ 离心柱上纯化 F(ab')2 片段,并通过降低 pH 值,然后立即调整回中性 pH 值,一步洗脱结合的 Fc 片段。使用 FabRICATOR Fab2 试剂盒从酶切到收集片段的过程大约需要 1 小时IgMBRAZOR酶能够对复杂和高分子量的人 IgM 进行中级分析,从而促进疫苗诊断等过程中的IgM表征和质量控制。

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与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。并通过反相LC-MS进行分析,消化产生均匀的Fab和Fc片段。河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

高特异性也意味着相同的消化方案可以作为平台方法应用于许多不同的抗体。河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同,Romiplostim 由四个相同的血小板生成素 (TPO) 受体结合肽和一个 Fc 片段组成,通过柔性聚甘氨酸序列连接在一起。与度拉糖肽类似,用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下过夜,或用 GlySERIAS 冻干 1 小时并在 37°C 下过夜消化该蛋白质。 链间二硫键被还原,以便于通过反相LC-MS进行以下分析。与度拉糖肽的观察结果类似,用固定化酶消化产生均质的 Fc/2,剩下一个连接子残基,此处为甘氨酸残基。这有助于识别专门位于Fc区域的修改。用冻干酶消化 1 小时得到 Fc/2,剩余 4 个甘氨酸残基和少量的 Fc/2 仍与一个 TPO 肽连接。另一方面,这使得研究 Fc/2 和第yi个肽之间的连接区域成为可能,而不会受到第二个肽的干扰。用 GlySERIAS 冻干液过夜消化产生 2 个 Fc/2 变体,分别剩下 4 个和 1 个甘氨酸残基。根据消化时间的不同,使用冻干产物释放的肽以五或七种变体存在,接头中残留的甘氨酸残基数量不同,而使用固定化产物释放的肽以四种变体存在。河北GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

标签: IdeS蛋白酶