RNA各种可逆的化学修饰被认为是一种新的表观遗传调控方式。m6A是真核生物mRNA常见的化学修饰,在调控mRNA稳定性,剪切和翻译方面具有重要的作用。作者使用转录组测序发现了METTL3(甲基转移酶3),一种主要的RNAN6-腺苷-甲基转移酶,在人肝细胞(HCC)和多种实体中高表达。在临床上,METTL3的过度表达与肝细胞患者不良预有关。体外实验证明敲除METTL3会抑制HCC细胞增殖,迁移及克隆形成。体内实验证明敲除METTL3会明显抑制HCC体内成瘤和肺转移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系统,内源性高表达METTL3会促进HCC细胞在体外和体内生长。通过转录组测序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者确定了SOCS2(细胞因子信号2的抑制因子)作为METTL3介导的m6A修饰的下游靶基因。敲除METTL3表达会消除SOCS2mRNAm6A修饰并增强SOCS2mRNA表达。m6A介导的SOCS2mRNA降解是依赖于m6A“读取器”蛋白YTHDF2。总之,METTL3在HCC大部分高表达中,并通过m6A-YTHDF2依赖机制抑制SOCS2表达从而促进HCC进展。因此,作者发现了在肝发生过程中表观遗传改变的一种新机制。图4RNA甲基化转移酶METLLT3在肝组织中高表达。实验技巧——做好细胞冻存,保证细胞质量。河北小鼠科研技术服务购买

外泌体作为药物载体由于特殊的结构和循环方式,外泌体作为药物运输的载体具有独特的优势。例如外泌体的尺寸分布能够增强渗透滞留效应,从而有选择性地深入组织;其外层磷脂双分子层可以保护内容物不受各种生物酶的影响,维持各种生物分子的活性;外泌体普遍存在于各种体液和组织中,其体积小,结构、组成与细胞膜类似,导致外泌体可以在避开免疫系统监督的同时深入组织内部,有较好的生物相容性;当采用内源外泌体时,能明显降低其他药物载体可能引起的有害免疫反应;除此之外,某些细胞来源或经特殊修饰过的外泌体具有良好的特异性,可以与特定的或组织结合。因此,载药成为外泌体研究的一个重要分支,具有良好的应用前景。在外泌体中引入药物的方式包括体内装载和体外装载两种。体内药物装载可以通过传统方法(如病毒转染、脂质体转染或电穿孔等)转染来源细胞,编码感兴趣的RNA或蛋白质,也可以使药物与来源细胞共混,使细胞分泌产生含有目标生物分子的外泌体。体外药物装载则首先需要得到纯化的外泌体,然后将感兴趣的药物通过电穿孔或脂质体转染等方法装入纯化的外泌体。外泌体内可装载的药物包括小分子化学药物、蛋白质和多肽、核酸药物、天然产物等。河北小鼠科研技术服务购买常用于研究细胞的成瘤能力、细胞的转移、细胞的耐药和靶分子对肿瘤细胞的发展的影响等等。

是整体甲基化进程所必须的[2]。FTO是ALKB家族的成员,作为个被发现的去甲基酶,可影响剪切因子SRSF2的RNA结合能力,进而调控pre-mRNA的剪切加工过程[3]。目前已发现FTO调节异常与肥胖、大脑畸形和生长迟缓相关,揭示m6A可能对这些疾病具有重要的调节功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被发现具有去甲基作用的另一个成员,以RNaseA敏感的方式与核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影响新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表现出精子发生异常,这可能是精子发生相关基因表达改变的结果[7]。m6AmRNA修饰执行其功能主要通过两个途径:精细调控甲基化转录本的结构,以阻止或诱使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A结合蛋白识别,诱发续反应。目前一类含有YTH功能结构域的蛋白被鉴定为m6A修饰的结合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被证实是m6A的结合蛋白.YTHDF1主要影响m6A修饰基因的翻译,YTHDF2主要影响m6A修饰基因的降解,而YTHDC1结合m6A修饰的基因影响其剪接。HNRNPC是一种丰富的核RNA结合蛋白,参与pre-mRNA的加工[8]。
且研究表明HNRNPC通过m6A与RNA结合调控目标转录本的丰度和选择性剪切[9].图1m6A修饰的酶系统[10]m6A生物学功能越来越多的证据表明m6A修饰在哺乳动物中发挥重要的生物功能。例如,在转录水平上调控RNA的稳定性[11]、定位[12]、运输、剪切[13]和翻译[14]。ClaudioR.等发现依赖METTL3的pri-miRNA甲基化,会促进DGCR8识别和加工,从而促进microRNA的成熟[15]。此外,m6A识别蛋白HNRNPA2B1促进pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,环状RNA上m6A的修饰能促进环状RNA的翻译[17]。m6A修饰在基因表达调控中起着重要的作用,其调控机制的异常可能与人类疾病或相关。目前发现m6A可能会影响精子发育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、发育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV诱导的DNA损伤反应(METTL3,FTO)、生成(YTHDF2)或转移(METTL14)、干细胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物节律、细胞发育分化、细胞分裂及其它的一些生命过程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修饰,其特点是凋亡影响减数分裂中期的精子细胞,引起生育能力受损[7]。METTL3和METTL14增加弱精症精子的m6A水平[18],在生殖细胞中,METTL3的敲除严重抑制精子分化和减数分裂的发生。protocol 分享|小鼠卵巢组织切片 HE 染色。

m6A研究又有新手段了?赶紧来了解一下吧!栏目:研究动态发布时间:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,目前主要的研究思路包括差异表达的write,reader和eraser基因分析;m6A抗体检测全转录组甲基化水平;分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章,小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别,如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理,作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理,然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点,ACA处被完全剪切,测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析(图3)。ELISA试剂盒在国内有许多种叫法,例如:ELISA检测试剂盒、ELISAKit。河北小鼠科研技术服务购买
通过不同分组之间的细胞对于划痕区修复能力的不同,可以判断各组细胞的迁移与修复能力的差别。河北小鼠科研技术服务购买
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