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湖北质谱成像与空间代谢组学

来源: 发布时间:2023年03月07日

空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。湖北质谱成像与空间代谢组学

作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。湖北质谱成像与空间代谢组学欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研,。

获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱(图5D,G)以及平均差谱,以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异(图5E,H)。制作的图像显示了属于注射侧(红色)或非注射侧(绿色)的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征,与对侧正常侧(非注射侧)相比,再髓鞘损伤(注射侧)发生了高度特异性的分子变化,尤其是正离子模式(图5F,I)。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰,并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明,再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布,这是脱髓鞘后新形成的髓鞘与正常髓鞘相比具有明显的分子特征和相对脂质成分差异的***个直接指标。

本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷脂富含长链、多不饱和的PGs。并且,遗传学研究表明,这一机制与脂肪酸从头合成有关。这些结果表明,空间代谢组学可以区分恶性食管中的组织类型。在临床应用包括客观诊断和术中切缘评估具有潜在价值。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析。


空间代谢组学:一种高灵敏、高覆盖质谱成像技术新技术。

1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示,将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描,并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图,在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像,在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明,AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm,代谢物质量比较大差异为0.001Da,同一物质的检测动态范围高达1000倍。如图1所示,通过AFADESI-MSI可在大鼠脑部检测到一些呈特征性分布有代表性的极性代谢物,其强度范围从0到104甚至到106。一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。湖北质谱成像与空间代谢组学

空间代谢组学研究应用前景广阔。湖北质谱成像与空间代谢组学

1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。湖北质谱成像与空间代谢组学

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