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江苏建库酵母文库

来源: 发布时间:2023年02月03日

小欧从2018年即开始关注酵母杂交与高通量测序相结合的技术发展,如2017年CaoGang老师等发表的RLL-Y2H技术,实现了文库筛文库可能,该技术通过对酵母双杂常用载体的改造,并结合高通量测序,可直接获得AD-BD互作蛋白对。所用方法相当巧妙,感兴趣的同学请点击《当酵母双杂交遇到高通量测序》。钮老师团队之前的研究已经鉴定了DAL1作为一种保守的针叶树年龄生物标记基因,在油松从营养生长到生殖生长的时相转变过程中起重要作用。为了进一步理解年龄效应如何驱动针叶树的发育,阐明与DAL1相关的蛋白互作网络很关键。钮老师团队利用传统的Y2H筛选技术结合NGS测序技术,优化得到了Y2H-seq技术,与传统的筛选测序相比,大幅度节省了时间和实验成本。酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸。江苏建库酵母文库

酵母文库实验:MAPK级联***是植物防御病原体入侵信号传导过程中的关键事件,MAPKs靶向并磷酸化调节下游基因转录的转录因子,**终响应病原菌的侵入。WRKYs转录因子是MAPK级联的重要目标,在植物对各种病原体的抗性中起着关键作用。苹果如何响应炭疽菌入侵,将信号传导到细胞内,以及哪个转录因子负责协调促进GLS耐受均尚不清楚。本研究在苹果炭疽叶枯病易感品种“嘎拉”中发现了一个由苹果炭疽菌******诱导的转录因子MdWRKY17。在6个易感苹果种质中,MdWRKY17表达水平***高于6个耐受苹果种质,同时对应的水杨酸含量降低,证实了MdWRKY17介导的水杨酸降解在GLS耐受中的关键作用。江苏建库酵母文库欧易生物提供的酵母杂交技术服务已经协助科研用户发表了Science、Cell、PNAS等多家前列期刊杂志。

酵母双杂交文库:本研究通过7个树龄的油松样品转录组测序,鉴定到一个与年龄信号***相关的基因模块,该模块包含33个转录因子,包括SOC1-like、DAL1等。油松和晚坐果白皮松突变体中的基因表达模式分析显示,PtMADS11与生殖能力之间存在紧密相关性。酵母双杂交显示,MADS11和DAL1直接相关作用以参与对年龄信号的调控。过表达PtMADS11、PDAL1可以部分挽救拟南芥中miR156过表达或spl突变导致的开花延迟缺陷。只有PtMADS11可以挽救ft突变体中的开花缺陷,表明它与PtDAL1在拟南芥开花调控网络中发挥了不同的作用。

酵母文库实验本研究鉴定了一个可以与MdMYB9相互作用的蛋白MdTRB1。实验表明,MdTRB1可以正向调节花青素和原花青素的累积。MdTRB1与MdMYB9结合可以增强后者对下游基因的转录***活性。而MdTRB1与MdJAZ1的结合,可以干扰其与MdMYB9的互作,进而负向调控MdTRB1介导的对花青素和原花青素积累的促进作用。本研究表明,JAZ1-TRB1-MYB9复合物可以动态调控JA介导的花青素和原花青素的积累。本研究为进一步研究JA对花青素和原花青素生物合成的调节提供了新见解。酵母文库是欧易生物***服务项目。

文章中酵母文库实验由欧易生物完成。2021 年 3 月,扬州大学陈忱教授为通讯作者,在 The Plant Journal 杂志(IF: 6.141)在线发表了题为“The rice LEC1-like transcription factor OsNF-YB9 interacts with SPK, an endosperm specific sucrose synthase protein kinase, and functions in seed development”的研究论文,报道了 OsNF-YB9 在调控水稻种子发育中的作用机制。NF-Y转录因子家族成员LEC1在拟南芥胚胎发生和种子发育中发挥了重要作用。水稻中的OsNF-YB9和OsNF-YB7是拟南芥LEC1的同源基因。这些LEC1同源基因在水稻中的作用尚未经报道。酵母杂交技术兼具通量高、结果直观、操作简易,重复性好的优势。江苏建库酵母文库

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酵母双杂交筛选实验:为进一步了解LEA3蛋白在干旱胁迫下调控植物生长和增强抗旱性的分子机制,本研究以干旱胁迫条件下的棉花根茎叶为材料,构建了棉花干旱胁迫酵母文库。并以GhLEA3为诱饵,采用酵母双杂交筛选实验,从棉花酵母文库中筛选获得了GhLEA3互作蛋白,并对互作蛋白进行了GO和KEGG分析,发现其中的互作蛋白GhVDAC1主要参与钙信号通路和cGMP-PKG信号通路,互作蛋白Gh***A参与多种生物途径,如糖原生成和代谢途径。此外,GhVDAC1和Gh***A受干旱胁迫诱导表达***,且在GhLEA3敲除的棉株中表达量低于野生型棉株江苏建库酵母文库

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