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山西运用酵母文库做什么

来源: 发布时间:2023年02月01日

酵母双杂交(Y2H):植物转录因子(Plant transcripter factors, TFs)是调控植物生长发育和环境适应性的关键分子。虽然在一些数据库中,如RiceSRTFDB (Priya and Jain, 2013), Ricettissuetfdb (Chen et al.,PlnTFDB (Pérez-Rodríguez et al., 2009)和PlantTFDB (Jin et al., 2017),可以预测水稻转录因子功能。但通过具体实验研究,来直接证实转录因子对植物的调控作用仍然是必不可少的。酵母双杂交(Y2H)和酵母单杂交(Y1H)是被用于研究蛋白-蛋白以及蛋白-DNA互作的**常用技术。为了方便和促进水稻育种研究,陈凡老师与欧易生物达成合作,整合双方优势资源,历经春秋与冬夏,成功构建了基于粳稻(日本晴)基因组的水稻转录因子文库。该项成果以“一种高效的筛选系统来鉴定大米转录因子的蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA相互作用伙伴”为题,发表于杂志JGG上。酵母杂交案例专业的硕博团队。山西运用酵母文库做什么

酵母文库:细菌鞭毛蛋白是一种重要的细菌毒力因子,可刺激动植物细胞中的分子免疫信号转导。脊椎动物识别鞭毛蛋白和建立有效免疫反应的详细机制已经被揭示;然而,无脊椎动物是否能够识别鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山东大学王显伟团队在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上发表了题为“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究论文,揭示了MjShoc2可以与鞭毛蛋白FlaA互作,引发一系列炎症反应,促使对虾抵抗细菌***,为无脊椎动物对鞭毛蛋白的感知机制提供了见解。该项目中所用的对虾酵母文库由欧易生物构建。山西运用酵母文库做什么21天定制自己的酵母文库,花一份钱拥有“四个库”。

目前,欧易生物负责该水稻转录因子文库的维护和保存工作,并对广大水稻科研工作者提供转录因子筛选服务。如去年欧易生物助力中国科学院分子植物科学***创新中心的王二涛老师应用该文库对水稻-丛枝菌根进行了深入研究,成功构建了水稻-丛枝菌转录调控网络,结果发表于《Cell》封面。截至文章发表,该文库已收录了1683个水稻转录因子,隶属于54个家族,覆盖预测的水稻转录因子总量的70%。文库中水稻转录因子的a基因信息来源于PlantTFDB和KOME数据库。文库载体使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一个转录因子菌株**保存于96孔板中。

酵母文库:2021年11月,山东农业大学园艺科学与工程学院张振鲁团队在MolecularPlantPathology(IF:5.663)发表了题为“Nitrate-inducibleMdBT2actsasarestrictionfactortolimitapplenecroticmosaicvirusgenomereplicationinMalusdomestica”的研究论文,报道了MdBT2蛋白在抑制病毒ApNMV基因组RNA复制中的作用。文章中所用酵母文库为欧易生物构建。ApNMV与ApMV相似,含有3种正义单链基因组RNAs:RNA1(编码1a蛋白,后面你会经常看到它,对病毒复制至关重要),RNA2(编码RNA聚合酶)和RNA3(编码MP),以及在3种RNA中排名第4的RNA4(编码CP)。当然苹果如何抵抗ApNMV的研究机制就更少了。合作文章上百篇,平均影响因子高达7.124 欧易生物酵母文库。

利用酵母文库进行双杂交筛选,结果显示 MdBT2 可以与 MdRGL3a 结合。MdRGL3a 编码 GA 信号阻遏物 DELLA 蛋白,主要分布于细胞核中。MdRGL3a 对于 GA 处理非常敏感,可以引起其发生降解,PAC 处理可以提高其稳定性。进一步的酵母一对一杂交验证实验表明,两者的结合依赖于 MdBT2 的 BTB 和 BACK 结构域、MdRGL3a 的 LHRI 和 SAW motif(图 A-B)。并通过 GST pull-down、BiFC 实验也证实了 MdBT2与 MdRGL3a 的结合(图 C-D)。细胞外降解实验显示,与对照相比,MdRGL3a 与过表达 MdBT2 的愈伤组织的总蛋白共同孵育,会导致 MdRGL3a 的降解加快;而与抑制 MdBT2 表达的愈伤组织的总蛋白共同孵育,会导致 MdRGL3a 的降解减缓(图 A)。并且蛋白酶体抑制剂 MG132 可以***抑制 MdRGL3a 的降解(图 B)。改变 MdRGL3a 表达量并不影响 MdBT2 的降解。以上结果表明,MdRGL3a 可能通过 26S 蛋白酶体途径发生降解,而 MdBT2 可以抑制 MdRGL3a 的降解。酵母文库质量检测酵母基因功能鉴定。山西运用酵母文库做什么

酵母双杂交文库构建实验流程。山西运用酵母文库做什么

文章中酵母双杂交文库由欧易生物制备。2021年5月,北京林业大学钮世辉副教授为通讯作者,在PlantPhysiology杂志(IF:6.902)在线发表了题为“MADS-boxtranscriptionfactorsMADS11andDAL1interacttomediatethevegetative-to-reproductivetransitioninpine”的研究论文,深入探讨了油松中营养生长-生殖生长时相转变调控的分子机制。北京林业大学马晶晶博士为***作者,文章中酵母双杂交文库由欧易生物制备。本研究通过 7 个树龄的油松样品转录组测序,鉴定到一个与年龄信号***相关的基因模块,该模块包含 33 个转录因子,包括 SOC1-like、DAL1 等。山西运用酵母文库做什么

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