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河北植物冷冻切片与空间代谢组学

来源: 发布时间:2022年12月01日

作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA,发现MYC**中不饱和脂肪酸(FA(18:1))的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢,而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时,细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。欧易生物空间代谢组学,服务好,科学领域,提供方向。河北植物冷冻切片与空间代谢组学

空间代谢组学:该技术解决了生物组织中低含量代谢物难检测、覆盖种类少和成像质量差等技术难题,可实现生物组织中约1500个代谢物的成像分析,包括胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类和脂质类等,并精确表征与识别功能代谢物在组织亚区域的分布特征。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。河北植物冷冻切片与空间代谢组学空间代谢组技术特点。

AFADESI空间代谢组技术:免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,经过2021年一整年的研发及项目运营落地,鹿明生物积赞了如下优势。一、专家支持AFADESI-MSI原创团队**专家-贺玖明教授(中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI)全力支持,参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上发表10+篇。

空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病的发生。中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。

作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。空间代谢组学基本研究流程。河北植物冷冻切片与空间代谢组学

空间代谢组特异性强等优点。河北植物冷冻切片与空间代谢组学

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。河北植物冷冻切片与空间代谢组学

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