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陕西运用酵母文库

来源: 发布时间:2022年08月29日

酵母文库实验:本研究报道了 OsNF-YB9 和 OsNF-YB7 在水稻中呈现亚功能化。OsNF-YB7 主要在胚中表达,而 OsNF-YB9 主要在发育中的胚乳中表达。在拟南芥 lec1-1 中异源表达 OsNF-YB9  OsNF-YB7 可以弥补 lec1-1 缺陷。OsNF-YB9 功能缺失导致种子发育异常,种子变长、变窄、变薄,垩白率较高。此外,osnf-yb9 中淀粉合成相关基因的表达紊乱。OsNF-YB9 可以与主要在水稻胚乳中表达的蔗糖合酶蛋白激酶 SPK 相互作用。spk 敲除突变体种子与 osnf-yb9 突变体种子都表现出垩白增加的表型。OsNF-YB9 在水稻和拟南芥中的异位表达导致了种子变小。综上表明,OsNF-YB9 在水稻种子发育中起到关键调控作用。酵母单双杂交服务促销季技术服务。陕西运用酵母文库

酵母双杂交还可以这么用?Y2H-seq 揭示不老松年龄。***小欧又给大家带来了一篇酵母双杂交结合高通量测序技术的应用文章。北京林业大学钮世辉老师团队,在传统的酵母双杂交技术流程基础上,巧妙的结合了NGS技术,优化建立了Y2H-seq技术,**缩短了常规的筛库后测序验证周期,节约了实验成本。文章中应用Y2H-seq技术,对不老松年龄密码进行了有趣的研究,其中所用酵母双杂交文库由欧易生物协助完成。众所周知,酵母双杂交技术是研究蛋白相互作用的利器。目前已知的蛋白质相互作用至少有一半是通过酵母双杂交技术发现的。但是做过酵母杂交实验的小伙伴也都知道蛋白筛选较容易,但是筛选后,想知道获得的阳性克隆都对应的是啥基因,所花费的人力物力相当不小。有困难解决困难,勇敢牛牛不怕困难。陕西运用酵母文库不懂就问,酵母文库实验室究竟长啥样?拥有十余年丰富的文库构建。

酵母文库:细菌鞭毛蛋白是一种重要的细菌毒力因子,可刺激动植物细胞中的分子免疫信号转导。脊椎动物识别鞭毛蛋白和建立有效免疫反应的详细机制已经被揭示;然而,无脊椎动物是否能够识别鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山东大学王显伟团队在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上发表了题为“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究论文,揭示了MjShoc2可以与鞭毛蛋白FlaA互作,引发一系列炎症反应,促使对虾抵抗细菌***,为无脊椎动物对鞭毛蛋白的感知机制提供了见解。该项目中所用的对虾酵母文库由欧易生物构建。

酵母单杂交测试:为验证该文库在Y2H和Y1H体系中的有效性,作者以OsMADS1为诱饵筛选水稻转录因子文库,进行了酵母双杂交测试。以Ghd7的启动子片段为诱饵,进行了酵母单杂交测试。结果显示我们的水稻转录因子文库可以有效且高通量的检测蛋白-水稻TF、DNA-水稻TF间的相互作用。另外,该研究中指出,使用该文库筛选鉴定蛋白-TF互作,采用mating法较为方便,即Y2HGold-Bait诱饵菌液与Y187-TF文库菌液一对一杂交。而筛选鉴定DNA-TF互作,采用Y1HGold系统,即Y1HGold-pomoter筛选TF文库质粒更简单高效。此外,可通过降低筛选压力处理,进行弱相互作用的检测。进口试剂高服务质量市场份额大酵母文库。

酵母双杂交(Y2H):植物转录因子(Plant transcripter factors, TFs)是调控植物生长发育和环境适应性的关键分子。虽然在一些数据库中,如RiceSRTFDB (Priya and Jain, 2013), Ricettissuetfdb (Chen et al.,PlnTFDB (Pérez-Rodríguez et al., 2009)和PlantTFDB (Jin et al., 2017),可以预测水稻转录因子功能。但通过具体实验研究,来直接证实转录因子对植物的调控作用仍然是必不可少的。酵母双杂交(Y2H)和酵母单杂交(Y1H)是被用于研究蛋白-蛋白以及蛋白-DNA互作的**常用技术。为了方便和促进水稻育种研究,陈凡老师与欧易生物达成合作,整合双方优势资源,历经春秋与冬夏,成功构建了基于粳稻(日本晴)基因组的水稻转录因子文库。该项成果以“一种高效的筛选系统来鉴定大米转录因子的蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA相互作用伙伴”为题,发表于杂志JGG上。酵母文库筛选方案可提供核体系和膜体系筛库工作。陕西运用酵母文库

欧易生物是国内较早提供酵母杂交技术服务的生物公司,较早掌握Gateway和Smart两种建库方法。陕西运用酵母文库

酵母单杂交筛选:(4)在筛选到的转录因子中,***GL1促进HIV-2转录。***GL1在免疫细胞中***表达,并与HIV的其他转录***因子,即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用,本研究中显示HEK293T细胞中,***GL1过表达后,与LTR连接的萤火素酶表达上升近2倍,说明***GL1是一个转录***因子。值得一提的是,文章的背景介绍内容中,对应用其他技术(如RNAi、scRNA-seq、CRISPR等)对HIV转录调控方向的已有成果分析,发现这些方法为HIV-1的复制和潜伏期提供了见解,但并没有直接评估转录因子的结合和功能。文章中也对酵母单杂交技术与其他互作组技术(如Chip-seq、motif预测)进行了比较分析,发现eY1H技术对已识别因子的验证率为30-60%,同等或优于其他技术。陕西运用酵母文库

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