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北京MicroDrop-100数字PCR原理

来源: 发布时间:2022年06月02日

在定量PCR时,我们常常纠结一个问题,究竟是相对定量还是***定量呢?如今,你无需纠结了,因为数字PCR(digitalPCR)来了。尽管这两种技术有些类似,都是估计起始样品中的核酸量,但它们有一个重要的区别。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的***定量。因此特别适用于依靠Ct值不能很好分辨的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。超高灵敏度,适用于稀有序列及稀有突变的检测。北京MicroDrop-100数字PCR原理

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       数字PCR可以直接计算目标序列的拷贝数,因此无需依赖于对照样品和标准曲线就可以进行精确的***定量检测;此外,由于数字PCR在进行结果判读时*判断有/无两种扩增状态,因此也不需要检测荧光信号与设定阈值线的交点,完全不依赖于Ct值的鉴定,因此数字PCR的反应受扩增效率的影响**降低,对PCR反应***物的耐受能力**提高;数字PCR实验中标准反应体系分配的过程可以极大程度上降低与目标序列有竞争性作用的背景序列浓度,因此数字PCR技术也特别适合在复杂背景中检测稀有突变。北京MicroDrop-100数字PCR原理能检测低至0.01%的突变基因。

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       微滴式数字PCR系统在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。


与传统PCR相比所具有的优势

       不依赖Ct值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的***数目。微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用。





研究方向

       低丰度及稀有序列的精确定量

       目前对于低丰度目标序列的检测,定量PCR、杂交、毛细管测序及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下,其重复性就不是很高), 而微滴式数字PCR系统通过**的微滴  化处理,使得稀有的核酸序列从大量的背景DNA中分离出来,从而提高了检测的灵敏度及重复性。

       此外,由于样品微滴化处理的同时,也将样品中可能存在的***剂进行了分装,提高了数字PCR扩增对于***剂的耐受程度,因此可具体应用于很多临床样品(血液、尿液、粪便、痰液、脑脊液等)中对**核酸标记物的检测。一般而言,毛细管电泳和定量PCR的检测灵敏度约在10%;NGS的灵敏度可达到1%;而ddPCR的检测下限为0.001%。 单次微滴生成*需2分钟。

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研究方向无创产前筛查无创伤的产前诊断,如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地贫检测或已知父母基因型的其它核酸病检测(孟德尔相关遗传疾病)。目前标本来源主要为血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。而QX200检测系统独特的微滴化技术完全可以作为二代测序法的补充来进行的无创伤产前诊断,从而提高工作效率及节约成本。转基因食品或成分的检测目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(CertifiedReferenceMaterialsCalibrants,CRMCs)。ddPCR***定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。正压生成油包水的液滴。北京MicroDrop-100数字PCR原理

双通道荧光检测,支持EvaGreen染料及探针法。北京MicroDrop-100数字PCR原理

        精细诊断是精细医学的关键环节,液体活检作为一种无创、均一的检测技术,迅速成为精细诊断领域的新星,2015年被《麻省理工大学科技评论》评选为年度**突破技术, 2017年入选世界经济论坛评出的全球**新兴技术,引发了全球科研、临床和产业界的极大热情,已在**、产前诊断、***移植等疾病领域***被应用。

       数字PCR技术与高通量的二代测序技术,共同组成液体活检领域的两大利器;数字PCR技术是公认的液体活检领域灵敏度比较高的检测方法,采用有限稀释的方法将目标分子分割到**的反应体系中,在不依赖标准曲线条件下实现靶标***定量检测,能检测低至0.01%的突变基因;Bio-Rad及Thermo Fisher目前是这一领域的主导者,分别采用微滴或芯片方式将样本分割成两万份,MiniDrop™创新性采用高压驱动的方法将样本分割成50万份,打破了国外厂商在微滴式数字PCR领域的垄断。



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