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杭州微滴式数字PCR

来源: 发布时间:2023年05月09日

数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。数字PCR仪广泛应用于医疗、农业、环境等领域。杭州微滴式数字PCR

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数字PCR(DigtalPCR)是一种核酸定量精密检测的新兴技术手段,于20世纪由Vogelstein等提出。它是将稀释后的核酸模板分配到大量不同的反应单元中,使每个反应单元中有一个或没有核酸。利用PCR扩增的同时,加入可检测荧光。待扩增结束时,使用统计学方法采集每个反应单元出现的荧光次数,从而定量检测样本中的核酸浓度。基于分液方式的不同,数字PCR主要分为3种:微流体数字PCR(MicrofluidicdigitalPCR,mdPCR)、微滴数字PCR(DropletdigitalPCR,ddPCR)和芯片数字PCR(ChipdigitalPCR,cdPCR)。杭州微滴式数字PCR全封闭体系,自动化流程操作。

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MicroDrop-100数字PCR系统具有如下优点:1、JUE对定量,结果判读不需要依赖标准曲线;2、突破局限,检测灵敏度可低至万分之一;3、专利设计的具有高精度复杂三维微纳防污染结构的微流控芯片,单张可同时处理1-8个样本;4、一键式自动操作,20uLPCR体系可生成100,000微滴,8个样本单次微滴生成 需2分钟;5、FAM、HEX(VIC)双荧光通道,半导体激光器做为激发光 源相比LED光源,稳定性高,功率稳定不影响检测灵敏度,单色性能优异降低对检测特异性的影响,且方向性好;6、检测器为2个光电倍增管,灵敏度及增益优于MPCC或CCD,普通的硅光子计数器,增益为10^5,光电倍增管增益可以达到10^9;7、 知识产权的软件系统可直接计算拷贝数、拷贝数浓度,CNV值,突变丰度;阈值线可自动或手动完成,每个样本可单独设定阈值线;输出数据图标、直方图、一维图、二维图、浓度图、95%置信度不确定性区间等;软件可自动识别复杂微滴分簇四簇;软件具备数据质控功能,支持阳性微滴数、阴性微滴数、总微滴数统计及这些指标的任意组合;单个样本100,000微滴的反应体系以及高灵敏度的检测系统,配以独特的软件系统,可以实现高达20重的PCR分析;8、单次检测通量96个样本,操作灵活;

研究方向无创产前筛查无创伤的产前诊断,如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地贫检测或已知父母基因型的其它核酸病检测(孟德尔相关遗传疾病)。目前标本来源主要为血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。而QX200检测系统独特的微滴化技术完全可以作为二代测序法的补充来进行的无创伤产前诊断,从而提高工作效率及节约成本。转基 因食品或成分的检测目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(CertifiedReferenceMaterialsCalibrants,CRMCs)。ddPCR***定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。支持多重数字PCR,可选全中文分析软件。

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研究方向基因表达差异研究检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的***定量,从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况:microRNA、lncRNAs等的表达分析、等位基因的不平衡表达、单细胞基因表达分析、Exosome内核酸分子定量分析等。拷贝数变异(CNV)研究微滴化的样品处理及检测,这种摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的***拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了***的检测精度。是其他诸如二代测序、芯片杂交等平台无法达到的,因此采用数字PCR能够有效对NGS、aCGH的实验结果进行验证,并具有成本低、通量高的特点。分辨率——低至0.1倍基因表达差异。杭州微滴式数字PCR

国内拥有完全自主知识产权的微滴式数字PCR仪。杭州微滴式数字PCR

数字PCR是一种核酸分子 定量技术。当前核酸分子的定量有三种方法,光度法基于核酸分子的吸光度来定量;,Ct值就是指可以检测到荧光值对应的循环数;数字PCR是***的定量技术,基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量,是一种 定量的方法。主要采用当前分析化学热门研究领域的微流控或微滴化方法,将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。杭州微滴式数字PCR

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