DNA病毒全序列测序服务

高通量基因组测序中，什么是测序深度和覆盖度？测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M，测序深度为10X，那么获得的总数据量为20M。覆盖度是指测序获得的序列占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在，测序终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域，这部分没有获得的区域就称为Gap。例如一个细菌基因组测序，覆盖度是98%，那么还有2%的序列区域是没有通过测序获得的。病毒全基因组测序具有的特点:独有的一定定量技术，实现病原定量分析.DNA病毒全序列测序服务

    有哪些技术手段能实现对病毒的全基因组进行测序呢？早期在高通量测序技术普及之前，对病毒的全基因组进行测序是通过非特异性扩增+克隆结合sanger测序来完成的。当物种有了参考的序列之后，可以通过特异性扩增+sanger测序获得全基因组序列。Sanger测序准确度高，读长很长，但与此同时，扩增和克隆工作费时费力，由于流程繁琐，加上快速变异导致引物无法通用，该方法对于大量基因组的测序工作而言，可操作性不强，这对于研究者一直是一个困扰。高通量测序技术正式启用之后，研究者可以将样品处理至标准浓度和体积后进行测序和分析，减少了工作量，增加了成功率。探普生物进行了大量有针对性的研发和测试，开发了全套的实验和分析流程用于对病毒的全基因组进行测序，该流程自运行以来广受研究者们好评。 DNA病毒全序列测序服务在探普生物长时间运行过程中，接触到的对病毒的全基因组进行测序的项目有比较丰富的应用场景。

对病毒的全基因组进行测序时，生物信息学分析是如何进行的？生存环境和状态决定了对病毒的全基因组进行测序的下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，专门搭载了生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括对非目标数据进行去除以及对目标序列进行筛选，高质量高完整度的序列拼接以及后续的高级分析，如SNP分析，进化分析，耐药位点分析等。在探普的流程下，可以获得完整性很高的基因组序列。

高通量测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术，可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定。现已普遍应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。高通量测序技术是对传统测序一次性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(nextgenerationsequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deepsequencing)。探普生物优化了自有数据库。

深度测序和个性化医学的范式相比，P4医学更强调早期预测和预防，强调对患者了解的系统性和参与性。准确医学的概念则是在基因测序普及的基础上，将整个个体的各种信息如生理信息（通过可穿戴设备可以即时监控和收集到）和肠道菌群变化、各种组学信息（深度测序测定）整合，进行准确的疾病分型、调整和预防。随着老年化时代的到来及临床资源的限制，基于这三种范式的健康管理以及准确诊疗将成为生物医学研究与应用的基本范式，走向大众生活，正如当年的计算机发展历程一样，会从原来的大型机器演变成可移动的小型工具。医学与健康的将来也会随着深度测序的普及和生物信息学数据处理能力的大幅度提高，而进入个性化的大众管理时代。 对病毒全基因组进行测序，是利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因组序列.DNA病毒全序列测序服务

团队具备普通测序实验和分析基础。DNA病毒全序列测序服务

深度测序技术对科学研究范式相关影响表现在：个性化医学、P4医学和准确医学等研究范式都是在近几年深度测序技术迅猛发展的基础上提出的。个人基因组测定的可行性，使得大众有可能测定和分析自己的基因组、寻找到个人健康相关的基因风险因素，从而可以在生活习惯、饮食等方面提早进行个性化预测和预防。由于互联网的发展和即时检验技术（point-of-care-testing，POCT）的应用，人们可以通过网络进行交流和参与到整个诊疗过程，这便是P4医学的概念：预测性（predictive）、预防性（preventive）、个性化（personalized）及参与性（participatory）。DNA病毒全序列测序服务